Dentro del material de consulta y exposición que se encuentra en el Ecomuseo, destaca la interesante colección referente a las 19 zonas naturales protegidas del estado de San Luis Potosí, que representan espacios de gran importancia por su enorme diversidad de flora y fauna.

Los asistentes a este recinto pueden encontrar material o ambientaciones propias de espacios como Wirikuta, el túnel Ogarrio, la Sierra de Álvarez, el Sótano de las Golondrinas, la Sierra boscosa de Xilitla o la Media Luna, entre otros. El Ecomuseo describe las biografía s oficiales de las 7 zonas naturales protegidas federales y las 12 estatales, donde se aplicó la metodología de los ecomuseos europeos, es decir, áreas naturales en convivencia con el hombre, asimismo, se describen la biodiversidad de las 4 zonas del estado. La zona Centro del estado está representada por las bellezas arquitectónicas de las presas que la conforman, como es el caso de la presa de San José; mientras que en la zona del Altiplano se contempla el recorrido realizado por los Wixárikas rumbo a Real de Catorce. A su vez, en la zona Media el atractivo es la belleza natural de la Media Luna, además de los productos agrícolas y artesanales típicos de la región.